Model MFMNet pomáhá vybírat slibné kombinace protinádorových léků
Výpočetní model propojuje údaje o struktuře léčiv s genovou aktivitou buněčných linií. Výsledky podporují jeho využití k předběžnému výběru kombinací pro další zkoumání, nikoli však jejich klinickou účinnost.
Vědci vyvinuli model MFMNet pro předpovídání, které dvojice protinádorových léků by mohly působit synergicky. Metoda kombinuje několik reprezentací molekulární struktury léčiv s údaji o lécích a transkriptomickými charakteristikami buněčných linií.
V přísnějším hodnocení se stejným rozdělením dat pro porovnávané metody dosáhl model u ukazatele AUROC hodnoty 0,9227 ± 0,0055 a u PR-AUC hodnoty 0,9127 ± 0,0084. Po Holmově korekci byly jeho výsledky statisticky významně lepší než u modelů XGBoost, DeepDDS-GCN a DeepDDS-GAT.
Hodnocení však vycházelo z pětinásobné křížové validace jednotlivých záznamů v souboru O'Neil. Ten obsahoval 13 243 označených záznamů, ale jen 38 různých léčiv a 31 buněčných linií. Výsledky proto zatím neukazují, jak by MFMNet fungoval u zcela nových léků nebo buněčných linií.
Autoři v časopise PLOS One uvádějí, že model může sloužit k výpočetnímu určování priorit mezi kandidátními kombinacemi. Jeho zobecnitelnost a biologický význam vybraných předpovědí vyžadují širší výpočetní i experimentální ověření.
MFMNet: Adaptive tri-layer graph pyramid with cross-scale attention router for synergistic drug prediction · Lei Wang, Liping Sun, Jingwen Pan, Guangming Shao, Guokun Shi, Guanyu Zhang et al. (2026), PLOS One, DOI: 10.1371/journal.pone.0362586. · Creative Commons Attribution License; version not stated in API
Wang et al This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited. Selected abstract and body passages only; no figure, table, dataset, logo or third-party media reuse.
České zpracování a případný překlad: novinky.nakupovani.cz, 2026, s využitím AI. Text byl zkrácen a redakčně upraven. Nejde o oficiální překlad ani schválení autorem či PLOS.
Ilustrace
Ilustrace
